Acquisition de 4 licences supplémentaires de la version 7.5 du logiciel Bionumerics utilisé au laboratoire de santé publique du Québec

Initialement, un projet de développement à l'interne ait été envisagé, par contre, les coûts associés à cette programmation étaient trop importants par rapport aux budgets alloués au projet. L'INSPQ s'est alors tournée vers une solution commerciale disponible et moins onéreuse. En 2013 le LSPQ a acquis cinq (5) licences de la version 7.0 de la solution progicielle BioNumerics de la compagnie Applied Maths. Ces licences ont été rehaussées à la version 7.5 récemment, tel que négocié avec le fournisseur au moment de l'achat initial. Trois (3) licences de la version 6.5 sont également utilisées dans le cadre d'un programme d'échanges de données de typage moléculaire de souches bactériennes pour le réseau international PulseNet. Ces licences seront également rehaussées à la version 7.5 par le gouvernement fédéral (ASPC), propriétaire des licences. Le module d'imagerie de ce logiciel pour les résultats d'électrophorèse sur gel en champ pulsé est le standard international et une exigence pour le partage de données d'un laboratoire à un autre via le réseau PulseNet Canada, un réseau électronique virtuel reliant les laboratoires de santé publique de toutes les provinces ainsi que certains laboratoires fédéraux par leurs ordinateurs et leurs bases de données. Le réseau national s'occupe de faire le suivi des empreintes génétiques de tous les cas d'infection à E. coli et de la plupart des cas de salmonellose. Le logiciel BioNumerics comprend également une série d'autres modules pour les études par inférence, la taxonomie, la biochimie, le séquençage d'ADN et l'accès aux banques de données publiques internationales. L'unicité du logiciel tient à l'intégration des différents modules d'analyse de données sur une seule interface informationnelle, ce qui facilite l'interprétation, l'échange et la gestion de données. Le logiciel est également compatible avec les systèmes Citrix et Oracle en utilisation au LSPQ. En suivi du projet d'innovation initial de 2010, le progiciel BioNumerics version 7.5 a été paramétré pour standardiser les flux de travail du séquençage de première et de deuxième génération dans les différents secteurs analytiques du LSPQ. Cette harmonisation des méthodes analytiques permet de réduire considérablement le nombre de logiciels académiques et commerciaux appliqués à la bioinformatique auparavant en usage au LSPQ. Le déploiement final requiert cependant des licences concurrentes supplémentaires afin d'assurer une fluidité du travail professionnel et technique dans les secteurs analytiques du LSPQ.