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Séquençage de génomes complets (WSG) de 700 et séquençage du transcriptome (RNAseq) de 271 individus

Source : SEAO

Université du Québec à Chicoutimi · Appel d'offres public · fermé le 11 décembre 2023 à 10 h 00, heure du Québec

Faits

Publication
24 novembre 2023
Délai d'adjudication
3 jours après la clôturemédiane, tous avis confondus : 26 j (sur 119539 avis)
comment c'est calculé — Délai d'adjudication

Délai d'adjudication — d'où vient le nombre

Le calcul
Jours civils entre la clôture (11 décembre 2023) et la première date d'adjudication publiée pour cet avis (14 décembre 2023) : 3 jours.
Ce qui entre
Pour cet avis, toutes les adjudications datées comptent, quel que soit leur statut, et la plus ancienne date est retenue. La médiane de l'ensemble des avis, elle, ne retient que les avis dont la plus ancienne adjudication gagnante datée, ni annulée ni infructueuse, tombe le jour de la clôture ou après — sur 119 539 avis.
La distribution
La source
SEAO — Données Québec · CC-BY 4.0 · données à jour au 4 octobre 2026 · lien vers ce détail
Nature du contrat
Services
Étapes documentées
Mise à jour de l'appel d'offres
Délai pour soumissionner
17 jours · calculé entre la publication et la clôture
comment c'est calculé — Délai pour soumissionner

Délai pour soumissionner — d'où vient le nombre

Le calcul
Jours entre la publication (24 novembre 2023) et la clôture (11 décembre 2023), arrondis au jour : 17 jours.
Ce qui entre
La source ne publie pas de durée pour cet avis : le nombre vient de ses deux dates. Un écart de moins d'une demi-journée, ou une clôture avant la publication, ne donne aucune fenêtre.
La source
SEAO — Données Québec · CC-BY 4.0 · données à jour au 4 octobre 2026 · lien vers ce détail
Montant
— non déclaré
Référence
Avis nº 1847-23 Appel d'offres
UNSPSC
85131709Services de recherche génétique
UNSPSC
77101820Analyses de laboratoire - services de laboratoire de chimie analytique, de biologie et de microbiologie
Catégorie SEAO
S1 — Recherche et développement (R et D)

SEAO, Données Québec · données du 4 octobre 2026

Description

100 %

L’Université du Québec à Chicoutimi (UQAC) est une université qui accueille chaque année plus de 6 500 étudiantes et étudiants, dont plus de 2 000 sont issus d’une cinquantaine de pays à travers le monde. Autant par la qualité des membres de son corps professoral que par les efforts soutenus de ses étudiantes et étudiants, l’UQAC se distingue au Québec, au Canada et mondialement grâce à ses projets de recherche.

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Elle contribue, notamment par l’entremise de ses créneaux d’excellence, à l’avancement de la recherche et de la création et au rayonnement de sa communauté. Dans le cadre d’un projet de recherche subventionné par les IRSC, il est prévu de faire séquencer le génome complet (WGS) de 700 individus. La technologie recherchée pour le séquençage est le NovaSeq X plus d’Illumina, ou une technologie équivalente ou moins récente développé par la même compagnie si celle-ci n’est pas disponible. La couverture visée est de 30X par échantillon avec une amplification de 150pb de type pairée ( paired-end ). Les échantillons d’ADN pour ce projet sont déjà extraits. En parallèle à ce projet, l’UQAC a également un autre projet subventionné aux IRSC pour lequel il sera requis de séquencer le transcriptome (RNAseq) de 271 échantillons. La couverture visée est de 50M de lectures par échantillon avec une amplification de 150pb de type pairée ( paired-end ). Les échantillons d’ARN pour ce projet seront extraits d’ici la fin décembre 2023. Pour les deux projets, la soumission devra inclure les étapes de génération, traitement, stockage et alignement des données soit sous forme de service (toutes les étapes étant réalisées par la compagnie soumissionnaire), soit sous forme d’accès aux outils d’analyse d’Illumina (BaseSpace Sequence Hub (BSSH) et iCredits pour l’utilisation du pipeline d’analyse DRAGEN). Une procédure ou plateforme sécuritaire devra également être en place pour le transfert des données. Pour des considérations éthiques, les échantillons ne pourront être acheminés à l’extérieur du Canada. Les séquences pour les deux projets devront être disponibles au plus tard au mois de mars 2024.

SEAO, Données Québec · données du 4 octobre 2026

Précédents — ce code chez cet acheteur

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Soumissionnaires

Soumissionnaires
EntrepriseMontant soumisRecevabilité
GÉNOME QUÉBEC421 171 $déclaréAdmissible et conforme
GÉNOME QUÉBEC421 171 $déclaréAdmissible et conforme

2 offres reçues · 2 montants déclarés sur 2 · 1 soumissionnaire déclaré par la source

SEAO, Données Québec · données du 4 octobre 2026

Le prix à battre

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Historique de l'acheteur — derniers contrats adjugés

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Adjudication

Lauréats et montants adjugés
AnnéeLauréatMontant
2023GÉNOME QUÉBEC421 171 $déclaré
2023GÉNOME QUÉBEC421 171 $déclaré
Contrats signés et leurs échéances
ContratSignéÉchéanceMontant du contrat
672784Le contrat signé dépasse le montant adjugé de 50 671 $ — +12,0 %. Un écart est un fait, pas un jugement : sur 121 996 paires comparables il existe dans 62 % des cas, et la moitié sont inférieurs à l'adjugé.20232 octobre 2024471 842 $déclaré

SEAO, Données Québec · données du 4 octobre 2026

Documents

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Permalien
https://www.laureo.ca/avis/ocds-ec9k95-1783577
Citation
Lauréo, « Séquençage de génomes complets (WSG) de 700 et séquençage du transcriptome (RNAseq) de 271 individus », Université du Québec à Chicoutimi, avis nº 1847-23 Appel d'offres, données du 4 octobre 2026, d'après le SEAO / Données Québec (CC-BY 4.0). https://www.laureo.ca/avis/ocds-ec9k95-1783577
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