Appareil d'électrophorèse capillaire

Cet appareil est indispensable dans notre laboratoire et pour celui de la cytogénétique, sans quoi plusieurs analyses ne pourraient être effectuées. Pour répondre à notre besoin, le CHUSJ désire acquérir un appareil d’électrophorèse sur capillaire ayant pour modèle ABI 3730XL . L’acquisition comprend aussi un contrat de consommable et un contrat de service pour une durée de cinq ans. Besoins du CHUSJ L’appareil proposé est totalement intégré et provient d’un seul et unique fournisseur. Toutes les composantes matérielles ou logicielles requises pour l’atteinte des exigences du devis technique et les composantes nécessaires au fonctionnement de l’équipement doivent être incluses dans la soumission et dans le coût de l’équipement soumissionné. L’appareil proposé doit avoir les dimensions externes maximales suivantes: Longueur max : 41 pouces Largeur max : 27 pouces Hauteur Max : 40 pouces Caractéristiques minimales L'équipement doit être doté de 48 ou 96 capillaires L'équipement devra permettre l'électrophorèse à une résolution au nucléotide près Analyse de séquences ADN (identification des bases, LOH, analyse des mutations, présence d'allèle mineur jusqu'à 5%, etc) Analyse de fragments d'ADN (détermination de fragments d'ADN): TP-PCR, MLPA, aneuploidie etc L'équipement doit pouvoir faire la collecte de données de séquençage Sanger (4 fluorochromes) et l'analyse de fragments (jusqu’à 6 fluorochromes) L'équipement doit supporter différentes longueurs de capillaires pour permettre la modulation des temps de migrations et les différents polymères L'équipement doit pouvoir produire des séquences d'ADN de qualité ( QV ≥20 ) de plus de 800 paires de bases, pour plus de 200 échantillons par jour L'équipement doit pouvoir analyser 400 échantillons (fragment analysis up to 500 pb) avec une résolution de 1.5 bp. L'équipement doit pouvoir analyser 48 à 96 fragments simultanément sans l'intervention de l'utilisateur après le chargement de la plaque. L'analyseur doit être compatible avec les méthodes actuellement utilisées (sur l'équipement 3730 de Thermo Fisher), sinon le soumissionnaire s'engagera à convertir toutes les méthodes utilisées au CHU Sainte Justine et procédera à toutes leurs validations L'équipement doit être automatisé pour le remplacement de polymères, la séparation de fragments (migration), la détection et l'analyse de données (base calls et size calls) L'équipement doit permettre de multiplexer jusqu'à six (06) fluorochromes pour les analyses de fragments La durée de l'analyse doit être comme suit: < 1 heure pour les chrimérismes pré et post greffe (STR) < 2 heure pour l'analyse de tailles de fragments < 2 heure pour le séquençage Sanger divers < 1 heure pour le Snapshot