PAC - SERVICES EN BIOINFORMATIQUE DE SÉQUENÇAGE MÉTAGÉNOMIQUE SHOTGUN

PORTÉE DES

TRAVAUX/PRODUITS LIVRABLES
L’entrepreneur doit :

• traiter 32 échantillons d’un essai de pâturage en rotation et fournir les fichiers importants générés par le pipeline;
• traiter 48 échantillons d’une expérience de pâturage à long terme avec un gradient d’élévation et fournir les fichiers importants générés par le

pipeline;

• traiter 48 échantillons d’une expérience de feu et de pâturage, et fournir les fichiers importants générés par le pipeline;
• traiter 80 échantillons de pâturages à long terme dans le centre de l’Alberta et fournir les fichiers importants générés par le pipeline;
• traiter 40 échantillons d’un essai de pâturage à long terme axé sur la profondeur du sol et la glycomique, et fournir les fichiers importants générés par

le pipeline;
- traiter tous les échantillons au moyen de la base de données CAZy.

CRITÈRES D’ÉVALUATION DE L’ÉNONCÉ DES CAPACITÉS
Tout fournisseur intéressé doit prouver au moyen d’un énoncé de capacités qu’il est un fournisseur de services en bioinformatique et qu’il est capable (expertise et capacité de calcul) de traiter les échantillons susmentionnés dans le pipeline bioinformatique ShotgunMG (https://github.com/jtremblay/ShotgunMG).

DURÉE DU CONTRAT : De la date d’attribution du marché au 31 mars 2024, avec possibilité de prolongation de trois (3) périodes d’un (1) an.

VALEUR ESTIMÉE : 18 375 $ (TPS incluse)

Périodes facultatives, le cas échéant :

Du 1er avril 2024 au 31 mars 2027 : 55 125 $ (TPS incluse).

ENTREPRENEUR PRÉSÉLECTIONNÉ
Julien Tremblay
1580 Beaudet
St-Laurent, QC, H4L 2K2

JUSTIFICATION DU RECOURS À UN FOURNISSEUR UNIQUE
AAC a effectué une recherche approfondie (une recherche en ligne des fournisseurs de services potentiels au Canada) pour des fournisseurs de services en bioinformatique qui peuvent utiliser notre pipeline métagénomique shotgun. Dans le cadre de notre recherche, nous avons constaté que la plupart des fournisseurs de services offrent seulement un profilage de la communauté du microbiome et que certains fournisseurs offrent des profils génétiques fonctionnels, ce qui n’est pas suffisant pour nos besoins (par exemple, ils n’utilisent pas l’étape de co-assemblage qui est essentielle pour nos analyses). Seul le fournisseur de services identifié consent et est apte à traiter nos échantillons au moyen du pipeline ShotgunMG qui est requis pour nos projets de recherche.

Exception au Règlement sur les marchés de l’État et motif de l’appel d’offres limité
L’alinéa 6d) a été invoqué pour ce marché, car un seul fournisseur (personne ou entreprise) est en mesure d’exécuter le contrat.

Lorsque, du fait qu’il s’agit de travaux d’art ou pour des raisons liées à la protection de brevets, de droits d’auteur ou d’autres droits exclusifs ou de renseignements de nature exclusive, ou en l’absence de concurrence pour des raisons techniques, les produits ou services ne pourront être fournis que par un fournisseur particulier et qu’il n’existera aucun produit ou service de rechange ou de remplacement raisonnablement satisfaisant.

PRÉAVIS D’ADJUDICATION DE CONTRAT (PAC)
L’État fait savoir par la présente qu’il a l’intention de n’inviter à soumissionner que l’entreprise susmentionnée. Pour toute question concernant ce marché, veuillez vous adresser à l’autorité contractante.

Un PAC est un avis public, d’une durée minimale de quinze (15) jours civils, informant la communauté des fournisseurs qu’un ministère ou un organisme a l’intention d’attribuer un contrat pour des biens, des services ou des travaux de construction à un fournisseur sélectionné à l’avance. Si, pendant la période d’affichage, aucun fournisseur ne présente d’énoncé des capacités répondant aux exigences précisées dans le PAC, l’autorité contractante pourra alors procéder à l’attribution du contrat. Toutefois, s’il s’avère qu’un énoncé des capacités remplit les exigences énoncées dans le PAC, l’autorité contractante lancera alors un processus d’appel d’offres en bonne et due forme.

Présentation d’un énoncé des capacités
Les fournisseurs qui s’estiment qualifiés et en mesure de fournir les services précités peuvent présenter par écrit, soit par la poste ou par courriel, un énoncé de capacités à la personne-ressource désignée dans le présent préavis, au plus tard à la date de clôture, également indiquée dans le préavis. L’énoncé des capacités doit clairement démontrer que le fournisseur satisfait les exigences indiquées dans le préavis.

Le numéro de la demande, le nom de l’autorité contractante et la date de clôture du PAC doivent être inscrits en caractères d’imprimerie dans l’énoncé de capacités.

La Couronne se réserve le droit de négocier tout achat avec les fournisseurs.

AUTORITÉ CONTRACTANTE
Melissa Smith, Spécialiste des contrats
Agriculture et Agroalimentaire Canada
Centre de services de l’Ouest
2010, 12e Avenue, bureau 300
Regina (Saskatchewan) S4P 4L3
Téléphone : (numéro sur l'avis officiel)
Courriel : (courriel sur l'avis officiel)