Génotypage d'échantillons de tissus porcins à l'aide du séquençage du génome entier à faible couverture propre au porc (SkimSEEK) et du pipeline d'imputation de Gencove

EXIGENCES

Agriculture et Agroalimentaire Canada conclura un marché avec Neogen Canada Inc. pour traiter et analyser des échantillons de tissus porcins à l’aide de la méthode « low-pass skim sequencing » (séquençage du génome entier à faible couverture) propre au porc (SkimSEEK) et du pipeline d’imputation de Gencove afin d’assurer la compatibilité avec les projets précédents. Les travaux se dérouleront sur une période de 27 mois, comme suit :

1 400 échantillons de tissus porcins seront prélevés avant le 31 mars 2025, 2 000 échantillons seront prélevés au cours de la deuxième année, et 2 000 échantillons seront prélevés au cours de la troisième année.

CRITÈRES D’ÉVALUATION DE L’ÉNONCÉ DES CAPACITÉS

Tout fournisseur intéressé doit démontrer, au moyen d’un énoncé des capacités, qu’il satisfait aux exigences suivantes :

Avoir l’autorisation d’utiliser le pipeline exclusif de Gencove au Canada pour l'imputation des génotypes à partir du séquençage du génome entier à faible couverture.

DURÉE DU CONTRAT

De janvier 2025 au 31 mars 2027

VALEUR ESTIMÉE : 309 600,00 $ CA

FOURNISSEUR SÉLECTIONNÉ À L’AVANCE

Neogen Canada Inc.
7323, Roper Road NW
Edmonton (Alberta) T6E 0W4

JUSTIFICATION DU RECOURS À UN FOURNISSEUR UNIQUE

L’ensemble de SNP offert par Neogen (SkimSeek) présente une combinaison unique de marqueurs génétiques. Il a été utilisé avec d’anciens échantillons (plusieurs études), et les nouveaux échantillons doivent être compatibles afin de pouvoir combiner les données avec précision.

Neogen a l'usage exclusif au Canada du pipeline exclusif de Gencove pour l'imputation de génotypes à partir du séquençage de génomes entiers à faible couverture, qui utilise une combinaison de logiciels libres et personnalisés pour fournir des appels de variants précis à travers le génome.

Exception au Règlement sur les marchés de l’État
L’alinéa 6 d) a été invoqué pour ce marché, car un seul fournisseur (personne ou entreprise) est en mesure d’exécuter le travail.

PRÉAVIS D’ADJUDICATION DE CONTRAT (PAC)

L’État fait savoir par la présente qu’il a l’intention de n’inviter à soumissionner que l’entreprise susmentionnée. Pour toute question concernant ce marché, veuillez vous adresser à l'autorité contractante.

Un préavis d’adjudication de contrat (PAC) permet aux ministères et aux organismes de publier un avis, pendant au moins quinze (15) jours civils, pour informer la collectivité des fournisseurs de leur intention d’attribuer un contrat pour des biens, des services ou des travaux de construction à un fournisseur sélectionné à l’avance. Si, pendant la période d’affichage, aucun fournisseur ne présente d’énoncé des capacités répondant aux exigences précisées dans le PAC, l’autorité contractante pourra alors procéder à l’attribution du contrat. Toutefois, s’il s’avère qu’un énoncé des capacités remplit les exigences énoncées dans le PAC, l’autorité contractante lancera alors un processus d’appel d’offres en bonne et due forme.

DATE ET HEURE DE CLÔTURE POUR LA PRÉSENTATION D’UN ÉNONCÉ DE CAPACITÉS

Les fournisseurs ont jusqu’au 15 janvier 2025, à 11 h (HNC), pour présenter un énoncé des capacités.

Les fournisseurs qui s’estiment qualifiés et en mesure de fournir les services précités peuvent présenter par courriel un énoncé de capacités à la personne-ressource désignée dans le présent préavis, au plus tard à la date de clôture, également indiquée dans le préavis. L’énoncé de capacités doit clairement démontrer que le fournisseur satisfait aux exigences établies.

Le numéro de la demande, le nom de l’autorité contractante et la date de clôture du PAC doivent être inscrits dans l’énoncé des capacités.

L’État se réserve le droit de négocier tout achat avec les fournisseurs.

AUTORITÉ CONTRACTANTE
Desta Kissack, superviseure, Approvisionnement et gestion du matériel
Agriculture et Agroalimentaire Canada
Centre de services de l’Ouest
303, rue Maine, pièce 4
Winnipeg (Manitoba) R3C 3G7
Téléphone : (numéro sur l'avis officiel)
Courriel : (courriel sur l'avis officiel)